Medicina / Ciências Médicas e da Saúde Dissertações de Mestrado
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Estudo de polimorfismos no locus do gene CDX2 em Portugal e Moçambique
Autor:
Nuno Miguel Morais Mendes
Mestrado em Medicina e Oncologia Molecular Faculdade de Medicina
Universidade do Porto
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Resumo O carcinoma gástrico constitui a segunda causa de mortalidade associada ao cancro no mundo. Uma grande parte dos casos de carcinoma gástrico de tipo intestinal é explicada pela inflamação crónica da mucosa gástrica provocada pela infecção pela H. pylori. Esta infecção desencadeia uma série de eventos na mucosa gástrica tais como gastrite, gastrite crónica atrófica e, em alguns casos, metaplasia intestinal (MI). Entre populações Europeias e Africanas há uma grande diferença na proporção de indivíduos que desenvolvem metaplasia intestinal no contexto da infecção pela H. pylori. Um dos factores envolvidos na infecção e desenvolvimento de lesões gástricas associadas reside nas características genéticas do hospedeiro. Num indivíduo adulto, o gene CDX2 é o “master gene” envolvido no estabelecimento e manutenção do epitélio intestinal normal e o seu papel na transdiferenciação da mucosa gástrica em mucosa de tipo intestinal encontra se bem definido e caracterizado. Contudo não há estudos que relacionem polimorfismos no gene CDX2 com o desenvolvimento de MI. Um dos objectivos deste trabalho consistiu no estudo da distribuição das variantes alélicas de 8 SNPs no locus do gene CDX2 em duas populações, Portuguesa e Moçambicana, em indivíduos com e sem MI. Identificamos um SNP (rs9285356) na população Portuguesa que se associa significativamente (P≤0,05) com a MI e, na população Moçambicana, um SNP (rs3812862) no promotor do CDX2 potencialmente associado com a MI. Verificamos haver, para este SNP, um aumento significativo de indivíduos homozigóticos T no subgrupo MI em comparação com o subgrupo MI+. O segundo objectivo deste trabalho foi estudar a distribuição haplotípica dos 8 SNPs nas duas populações, Portuguesa e Moçambicana, em indivíduos com e sem MI. Identificamos um haplótipo na população Moçambicana que se associa significativamente com o subgrupo Moçambicano sem metaplasia intestinal (haplótipo H23). No último ponto deste trabalho verificamos que não há indícios de ancestralidade genética europeia no subgrupo Moçambicano MI+ e que não é este o factor envolvido na maior predisposição destes ao desenvolvimento de MI, em relação à maioria da população. Perante estes achados, a realização de estudos funcionais e o aumento do efectivo amostral do subgrupo Moçambicano com MI são tarefas fundamentais para suportar a hipótese de que polimorfismos no gene CDX2 poderão ter um efeito “facilitador” ou “inibidor” do desenvolvimento de MI.
Índice
ABREVIATURAS
1.1. Carcinogénese gástrica CAPÍTULO II – Objectivos CAPÍTULO III – Materiais e Métodos 3.1. Amostragem populacional
3.1.1. Selecção das amostras 3.2. Selecção dos “Single Nucleotide Polymorphisms” 3.2.1. Desenho dos oligonucleótidos para PCR 3.3. Amplificação por “PCR Multiplex” 3.3.1. Purificação dos produtos de “PCR multiplex”
3.4. Desenho dos oligonucleótidos para SBE
3.5.1. Análise das amostras no “ABI PRISM 3100 Genetic Analyser” 3.6. Análise estatística CAPÍTULO IV – Resultados 4.1. Polimorfismos analisados no locus do gene CDX2
4.2. Minisequenciação por SNaPshot
multiplex® 4.7.1. AMOVA total 4.7.2. AMOVA para cada marcador
CAPÍTULO V – Discussão ANEXO I CAPÍTULO VII
Referências Bibliográficas
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