Conceito de RT-PCR
A
técnica
de RT-PCR (reverse transcription polimerase chain reaction) utiliza uma
enzima especial, a transcriptase reversa, que consegue produzir uma
molécula de DNA complementar (cDNA) a partir de uma molécula de RNA.
Pode ser utilizada para copiar um gene ou para determinar se um gene
está a ser transcrito num determinado tecido ou célula.
Apenas
são necessárias pequenas quantidades de RNA mesnageiro (mRNA), das quais
serão produzidas posteriormente milhões de cópias, evitando-se a
necessidade de uma elevada quantidade de amostra para se detetar e
quantificar a expressão de um determinado gene, que em muitos casos
seria impraticável. O mRNA também não está presente em grandes
quantidades nas células, uma vez que representa uma pequena percentagem
do RNA total e também porque é destruído após a tradução.
Inicialmente
extrai-se e purifica-se as sequências de mRNA presentes na amostra que
se pretende estudar. O mRNA é depois convertido em cDNA pela
transcriptase reversa, contudo esta enzima apenas sintetiza uma cadeia
simples. A cadeia dupla é produzida por uma DNA polimerase, através da
ligação de um primer específico à cadeia de cDNA simples produzida pela
transcriptase reversa. Previamente à realização desta técnica de
biologia molecular são desenhados dois primers que irão ser
complementares da sequência de cDNA alvo. Esses primers são adicionados
ao cDNA e irão ligar-se este apenas se a sequência que se quer estudar
estiver presente na amostra. Só nesse caso irá ocorrer amplificação do
cDNA. Os ciclos de amplificação ocorrem inúmeras vezes, obtendo-se no
fim do processo milhões de cópias de cDNA (como acontece durante o PCR
convencional) que depois será analisado através de uma eletroforese.
Existem
dois tipos de protocolos que poderão ser utilizados para a realização
desta técnica:
· One step RT-PCR – a síntese
do
cDNA e a reação de PCR ocorrem no mesmo tubo. Este protocolo simplifica
o processo e minimiza a ocorrência de contaminações. Apresenta elevada
sensibilidade, uma vez que os primers a utilizar têm de ser específicos
de apenas uma sequência;
· Two step RT-PCR – a primeira
etapa inclui a síntese do cDNA. Após a síntese da cadeia simples, o cDNA
é transferido para um novo tudo,
onde
irá ocorrer a reação de PCR. Permite uma maior flexibilidade dos
componentes a usar em cada reação e é ideal para a deteção e
quantificação de várias sequências.
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